Sisukord:
2025 Autor: John Day | [email protected]. Viimati modifitseeritud: 2025-01-13 06:57
Keemia ja füüsika arvutuslikud arvutused võivad mõnedel isenditel paljastada väga huvitavaid omadusi (eriti kui neid esialgse ühendi parema efektiivsuse huvides muudetakse). protseduurides peale dipoolmomendi, ebastabiilsuse, elektrostaatilise potentsiaali kaardi, energiadiagrammi ja propabilistliku reaktsioonivõime arvutamise tegurite, kus arvutuslike kvantarvutuste kasutamine lühendab laboriaega, muutes selgeks ja spetsiifiliseks, kas võimaliku ühendi süntees on elujõuline. ökonoomiliselt ja ajaliselt öeldes.
Tarvikud
- Kvant
- Molekulide modelleerimine.
- Molekulaarsed orbitaalid Orca Avogadro
1. samm: arvutuslik kvantmehaanika arvutamine - Avogadro
Esimese sammuna laadige alla Avogadro, millel on võimalus sisestada Orca tarkvaraga
Avogadro tarkvaras saate oma molekulid luua ja neid 99,9%optimeerida; vältida konflikte käsuga Ctrl + Alt + o, mis omakorda ei taga Orca sisendlaiendite kasutamisel õiget molekulaarset kokkusurumist.
Molekuli optimeerimiseks looge esmalt huvipakkuv molekul (ilmselgelt), seejärel klõpsake E (pange tähele, et selle E all on allanool), nii kuvatakse sarnane arvutus tarkvara sisaldava ekraani vasakus ülanurgas.
Samm 2: Tarkvara Orca
Kui see sisend on õigesti tehtud, klõpsake vahekaarti Laiendid, viidates endiselt Avogadro tarkvarale, ja otsige valikut ORCA
Kui sisendi loomise ekraan avaneb, klõpsake nuppu Täpsemalt ja kuupäeval märkige valik MO ja teine allpool. - JÄTKE KAKS MÄRKI - elektronide tiheduse ja aktiveeritud molekulaarbitaalide saamiseks Orca kvantarvutuste ajal - ainult sisendprotseduurid;)
Pärast sellist protseduuri vahekaardil Basic täitke pärast käsku:! RHF SP def2-SVP
sisestage kood õigesti / hoolikalt …
! Tavaline trükk
% väljund
Prindi [P_Basis] 2
Prindi [P_MO -d] 1
lõpp
DETAIL, enne sellise toimingu tegemist laadige alla ja installige Orca oma arvutisse!
Pärast ülaltoodud käskude täitmist klõpsake nuppu Loo ja salvestage selline fail. Sisestage kausta, kuhu Orca on installitud. (Näide: installisin Orca oma arvuti C -draivi -> salvestage fail oma arvuti C -draivi Orca kausta).
Samm: käivitage Cmd…
Ava cmd ja kirjuta:
cd C: / Orca; Orca tarkvara on teie arvuti C -draivi installitud ja vajutage sisestusklahvi.
Pärast seda protseduuri näete selle osa pildiga sarnast ekraani, märkige, kas käsk on skripti järgi õige: C: / Orca> Kui see käsk on õige, tippige käsk plussmärgi (>) ette:
orca.exe (Orca kausta salvestatud molekuli nimi).inp> (Orca kausta salvestatud molekuli nimi).out
ÜKSIKASJAD - KÄSKUS EI OLE SUHTESID JA AINULT OMA MOLEKULA NIMI
Pärast seda vajutage sisestusklahvi ja oodake … Minu puhul jätsin ma käsu mitu korda vahele, kuna sellega seotud paljusus on paaritu väärtus ja ka minu elektronide arv on paaritu, kui see juhtub, muutke paljundusväärtus 2 -ks eelmises etapis Basic (in Avogadro tarkvara).
Samm: oodake minut…
Pärast käsu andmist otsige allajoonimist cmd järgmiselt käsurealt
kui on, siis IME, jätkub… Oodake natuke, kuni ilmub skriptitermin:
cd: / Orca_
Veendumaks, et teie.out -fail loodi Orca installikausta, see, kuhu Avogadros loodud sisendfail salvestati.
Kui arvutus on tehtud Orca cmd kaudu, otsige kaustast Orca.out faili. Praegu saate oma molekuli (Avogadro) ja cmd sulgeda, lõpuks on kvantarvutus juba tehtud …
Järgmisel sammul avage Avogadro uuesti ja avage vahekaardil loodud.out -fail ja avage see; näete, et teie molekul on HOMO ja LUMO Orbital väärtuste kõrval, lohistage sakk veidi alla ja näete, et on olemas arvutused orbitaalide kohta, mis annavad umbes 100% optimeerimise, nagu pilt näitab.
…ja lõbutse…